Nezisková organizácia Pontis n.o. bola zaregistrovaná 18. januára 2008 v registri neziskových organizácií poskytujúcich všeobecne prospešné služby vedeného Obvodným úradom Bratislava pod registračným číslom OVVS−3789/245/2008−NO.
Zakladateľom neziskovej organizácie je Nadácia Pontis. Organizácia vznikla s cieľom ponúkať klientom nadácie všetky doplnkové služby, ktoré im nadácia zo zákona nemohla poskytovať (napríklad nadácia nemôže poskytovať služby pre iné nadácie alebo nemôže podnikať zo zákona).